Meski berakhir tragis, dampak operasi Eli Cohen dinilai sangat besar. Informasi intelijen yang berhasil dikirimkannya disebut membantu Israel memperoleh keuntungan strategis dalam Perang Enam Hari pada 1967.
Lebih dari enam dekade setelah kematiannya, nama Eli Cohen masih dikenang sebagai salah satu agen intelijen paling berpengaruh dalam sejarah Timur Tengah. Operasinya menjadi contoh bagaimana satu misi penyamaran mampu mengubah jalannya konflik dan hubungan antarnegara.